在華為開(kāi)發(fā)者大會(huì)2020(Cloud)期間，華為云發(fā)布全新AutoML工具AutoGenome，支持對(duì)基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行全自動(dòng)AI建模，助力科研人員探索生命奧秘。
目前，AI技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用在圖像、語(yǔ)音等領(lǐng)域，然而在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，尤其是基因組學(xué)數(shù)據(jù)領(lǐng)域，AI的應(yīng)用仍處于初期階段。主要原因是，由于基因組數(shù)據(jù)的復(fù)雜性，導(dǎo)致主流的基于圖像和文本的模型不能很好地對(duì)基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行建模;同時(shí)，由于A(yíng)I模型的搭建開(kāi)發(fā)門(mén)檻較高，需要開(kāi)發(fā)者有比較多的經(jīng)驗(yàn)。
華為云發(fā)布的AutoGenome，采用了超參數(shù)自動(dòng)搜索、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)自動(dòng)搜索和模型自動(dòng)解釋器等最新的AutoML技術(shù)，并且提出了全新的更加適用于基因組數(shù)據(jù)建模的殘差全連接網(wǎng)絡(luò)，在多項(xiàng)不同的基因組數(shù)據(jù)建模任務(wù)中，AutoGenome的準(zhǔn)確性都超出傳統(tǒng)模型5個(gè)百分點(diǎn)以上。
在開(kāi)發(fā)過(guò)程上，AutoGenome對(duì)于A(yíng)I的初學(xué)者非常友好，用戶(hù)在華為云ModelArts一站式AI開(kāi)發(fā)管理平臺(tái)可以一鍵啟動(dòng)Notebook開(kāi)發(fā)環(huán)境，只需要五行代碼即可快速完成端到端的基因組數(shù)據(jù)建模、準(zhǔn)確性評(píng)估和模型結(jié)束。
AutoGenome Examples已經(jīng)列入華為云ModelArts Notebook任務(wù)中
此外，華為云還聯(lián)合華為2012實(shí)驗(yàn)室媒體院研發(fā)了autosearch自動(dòng)化搜索框架并預(yù)置在華為云一站式AI開(kāi)發(fā)管理平臺(tái)ModelArts中，可以集成更多的automl搜索算法，便于支持更多的基因建模能力。
大會(huì)期間，中科院基因組所韓大力教授也現(xiàn)場(chǎng)分享了如何利用AutoGenome對(duì)羥甲基化組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行建模，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)肝癌的診斷。該案例中，借助AutoGenome的自動(dòng)建模比文獻(xiàn)報(bào)道的同類(lèi)工作準(zhǔn)確率高出八個(gè)百分點(diǎn)。
目前，AutoGenome已經(jīng)正式上線(xiàn)，用戶(hù)可在華為云ModelArts一站式AI開(kāi)發(fā)管理平臺(tái)上使用。
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