北京超算+深勢(shì)科技,共同打造藥物計(jì)算新范式

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醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)是與國(guó)民經(jīng)濟(jì)和民生息息相關(guān)的基礎(chǔ)和戰(zhàn)略性產(chǎn)業(yè)。根據(jù)《Nature》報(bào)道,新藥開(kāi)發(fā)的平均成本約為26 億美元,大約需要10 年,包括小分子化合物的長(zhǎng)期開(kāi)發(fā)階段、Ⅲ期臨床試驗(yàn)以及注冊(cè)批準(zhǔn)過(guò)程,其中,只有不到1 /10 的藥物可以成功通過(guò)并上市。高投入、高風(fēng)險(xiǎn)、低回報(bào),一直是藥企新藥研發(fā)的痛點(diǎn)。

而人工智能技術(shù)的出現(xiàn),給整個(gè)醫(yī)藥領(lǐng)域帶來(lái)巨大的變革。借助AI模型介入靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)解析、預(yù)測(cè)與精修、苗頭化合物篩選、先導(dǎo)化合物優(yōu)化和ADME/T性質(zhì)預(yù)測(cè)等諸多環(huán)節(jié),能夠有效加快藥物研發(fā)速度,降低研發(fā)成本,提高研發(fā)成功率,進(jìn)而提升藥企的投資回報(bào)率。這種通過(guò)AI學(xué)習(xí)底層原理或解決底層問(wèn)題,再進(jìn)一步解決這些原理所映射的工業(yè)問(wèn)題的方法,就是所謂的“AI for Science”新范式。

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成立于2018年的深勢(shì)科技,是AI for Science科學(xué)研究范式的先行者。深勢(shì)科技致力于運(yùn)用人工智能和分子模擬算法,結(jié)合先進(jìn)計(jì)算手段求解重要科學(xué)問(wèn)題,為人類(lèi)文明最基礎(chǔ)的生物醫(yī)藥、能源、材料和信息科學(xué)與工程研究打造新一代微尺度工業(yè)設(shè)計(jì)和仿真平臺(tái)。創(chuàng)新性地融合了跨尺度建模、高效采樣、高性能計(jì)算等技術(shù),在保持量子力學(xué)精度準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上,將分子動(dòng)力學(xué)的計(jì)算速度提升了數(shù)個(gè)數(shù)量級(jí),從而解決藥物和材料的微觀計(jì)算模擬難題。

在輔助藥物研發(fā)、實(shí)現(xiàn)藥物分子的理性發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì)方面,深勢(shì)科技推出的Hermite™藥物計(jì)算設(shè)計(jì)平臺(tái),致力于為藥物研發(fā)工作者提供臨床前的一站式解決方案。平臺(tái)融合了蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Uni-Fold、自由能微擾計(jì)算Uni-FEP等核心算法,為藥物研發(fā)工作者提供了一系列全新的計(jì)算模擬及設(shè)計(jì)工具,已被國(guó)內(nèi)外數(shù)十家創(chuàng)新藥企和上千位學(xué)術(shù)用戶(hù)廣泛應(yīng)用。同時(shí),基于平臺(tái)能力,深勢(shì)科技與業(yè)內(nèi)多家合作伙伴建立了十余條合作管線,覆蓋包括CNS、腫瘤和自身免疫性疾病等領(lǐng)域,目前部分管線已處于Pre-PCC階段。

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公司核心團(tuán)隊(duì)由中國(guó)科學(xué)院院士領(lǐng)銜,主要來(lái)自北京大學(xué)、普林斯頓大學(xué)、約翰霍普金斯大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、中科院上海藥物研究所、阿里、百度等世界一流高校、科研機(jī)構(gòu)和企業(yè),科研隊(duì)伍由物理建模、數(shù)值算法、機(jī)器學(xué)習(xí)、高性能計(jì)算及藥物和材料計(jì)算等多個(gè)領(lǐng)域的數(shù)十名優(yōu)秀青年科學(xué)家構(gòu)成。

團(tuán)隊(duì)核心成員獲得2020年全球計(jì)算機(jī)高性能計(jì)算領(lǐng)域的最高獎(jiǎng)項(xiàng)“戈登貝爾”獎(jiǎng),相關(guān)工作也入選由中國(guó)科學(xué)院院士和中國(guó)工程院院士投票評(píng)選的2020年中國(guó)十大科技進(jìn)展。

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深度勢(shì)能團(tuán)隊(duì)獲得戈登貝爾獎(jiǎng),圖源:深勢(shì)科技

在提供基礎(chǔ)算力服務(wù)上,深勢(shì)科技Hermite藥物設(shè)計(jì)平臺(tái)與北京超算合作,共同突破了藥物設(shè)計(jì)平臺(tái)基于超算架構(gòu)的云原生技術(shù),實(shí)現(xiàn)了在跨尺度建模、高效采樣、高性能計(jì)算等技術(shù)上的創(chuàng)新突破,在保持量子力學(xué)精度準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上,將分子動(dòng)力學(xué)的計(jì)算速度提升了數(shù)個(gè)數(shù)量級(jí)。

北京超算充分發(fā)揮資源優(yōu)勢(shì),為深勢(shì)科技打造藥物設(shè)計(jì)和材料研發(fā)平臺(tái)提供了強(qiáng)有力的適配算力支撐,助力其實(shí)現(xiàn)真正的創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)發(fā)展,從以下方面為深勢(shì)科技提供了強(qiáng)力護(hù)航:

上萬(wàn)+核/上百+卡算力秒級(jí)匯聚,無(wú)需等待時(shí)間;

裸金屬CPU核心/GPU卡,節(jié)點(diǎn)間高速I(mǎi)B網(wǎng)絡(luò)通信,以最低的價(jià)格實(shí)現(xiàn)最高的計(jì)算效率;

從計(jì)算任務(wù)開(kāi)始計(jì)算為計(jì)費(fèi)起點(diǎn),真正按需收費(fèi),精確到秒級(jí);

支持Docker,容器化調(diào)度等云原生技術(shù),協(xié)助研發(fā)以及生產(chǎn)環(huán)境流程化協(xié)作;

生命科學(xué)專(zhuān)業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)以及算法優(yōu)化團(tuán)隊(duì)專(zhuān)業(yè)支持業(yè)務(wù)流全棧定制化服務(wù);

未來(lái),北京超算將繼續(xù)與深勢(shì)科技這樣的創(chuàng)新AI企業(yè)展開(kāi)深度合作,將AI+HPC的模式推行至整個(gè)藥物研發(fā)行業(yè),助力AI制藥生產(chǎn)實(shí)踐難題破解,開(kāi)辟企業(yè)降本增效新路徑,共拓生命科學(xué)行業(yè)新生態(tài)。

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