天池大賽-“云上進(jìn)化”2022全球AI生物智藥大賽圓滿落幕

近日,由阿里云聯(lián)合NVIDIA、角井生物共同主辦的“云上進(jìn)化”2022全球AI生物智藥大賽在深圳圓滿落下帷幕。此次大賽旨在推動(dòng)云計(jì)算、人工智能(AI)與生命科學(xué)領(lǐng)域的交融與發(fā)展,通過(guò)使用人工智能技術(shù)來(lái)解決生物醫(yī)藥領(lǐng)域中的挑戰(zhàn)。

面對(duì)全球疫情的多次反彈、病毒的快速變異、疫苗突破性感染率上升,小分子藥的無(wú)后遺癥治愈復(fù)雜有難度,通過(guò)廣譜中和抗體在新冠病毒暴露人群進(jìn)行應(yīng)急預(yù)防和早期治療,成為鞏固疫苗接種形成的免疫屏障的重要手段。為了加快推進(jìn)廣譜中和抗體研發(fā)進(jìn)度,AI的輔助必不可少。AI輔助新冠病毒廣譜抗體藥的設(shè)計(jì),目前可以說(shuō)是業(yè)界公認(rèn)的圣杯,意義和價(jià)值重大。

本次大賽共分為“基于AI算法的SARS-CoV-2廣譜中和抗體藥物設(shè)計(jì)”和“抗原抗體結(jié)合Epitope和Paratope精準(zhǔn)確定”兩個(gè)賽道,吸引了世界各地共6258支高水平隊(duì)伍參賽。大賽中涌現(xiàn)出眾多優(yōu)秀算法方案,參賽選手使用語(yǔ)言模型、圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等多樣化的深度學(xué)習(xí)方法,在基于蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)等方面,對(duì)抗原-抗體對(duì)的親和力、活性和特異性進(jìn)行了多角度的建模分析和預(yù)測(cè)。經(jīng)過(guò)數(shù)月激烈角逐,本次比賽于2023年2月25日?qǐng)A滿落幕,頒獎(jiǎng)典禮在2022CHINC——阿里云數(shù)智健康與未來(lái)數(shù)智醫(yī)院創(chuàng)新發(fā)展論壇如期舉行。

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本屆大賽的顧問(wèn)團(tuán)由國(guó)內(nèi)外頂尖的生物醫(yī)藥專家和人工智能專家組成。大賽邀請(qǐng)到了哈佛大學(xué)統(tǒng)計(jì)系終身教授、清華大學(xué)統(tǒng)計(jì)研究中心創(chuàng)始人、角井科技創(chuàng)始人劉軍;中國(guó)工程院院士、北京大學(xué)博雅講席教授、北京大學(xué)國(guó)際癌癥研究院院長(zhǎng)、北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院院長(zhǎng)詹啟敏;中國(guó)科學(xué)院院士、上海市免疫治療創(chuàng)新研究院創(chuàng)始院長(zhǎng)、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授董晨;清華大學(xué)人工智能研究院常務(wù)副院長(zhǎng)、歐洲科學(xué)院外籍院士孫茂松;浙江大學(xué)醫(yī)藥學(xué)部副主任、浙江大學(xué)智能創(chuàng)新藥物研究院副院長(zhǎng)何俏軍等多位重量級(jí)專家作為大賽顧問(wèn),為參賽選手們答疑解惑。

經(jīng)過(guò)大賽評(píng)委對(duì)參賽作品的嚴(yán)格評(píng)審,最終happynewyear團(tuán)隊(duì)和paipai團(tuán)隊(duì)分別在兩個(gè)賽道上脫穎而出,獲得了本屆大賽的最高獎(jiǎng)項(xiàng)。

AI技術(shù)助力制藥行業(yè)駛向快車道

近年來(lái),AI+醫(yī)療的應(yīng)用場(chǎng)景不斷延伸,AI技術(shù)正日益廣泛地應(yīng)用于生物制藥領(lǐng)域,藥物研發(fā)正在經(jīng)歷前所未有的變革。傳統(tǒng)的藥物研發(fā)過(guò)程耗時(shí)數(shù)年,甚至數(shù)十年,且成功率低下。隨著AI逐漸應(yīng)用于藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、虛擬篩選、化合物/生物結(jié)構(gòu)合成、理化性質(zhì)預(yù)測(cè)等多個(gè)制藥流程,在一些創(chuàng)新藥物研發(fā)的細(xì)分領(lǐng)域,AI技術(shù)已經(jīng)百花齊放。

借助于AI技術(shù),研究人員可以更快、更精準(zhǔn)地篩選潛在的藥物靶點(diǎn)和化合物,并在更短的時(shí)間內(nèi)取得準(zhǔn)確的結(jié)果。同時(shí)在輔助評(píng)估藥物的活性和安全性,縮短研發(fā)周期,提高效率,降低成本,提高藥物質(zhì)量等方面也起到重要作用。在這一方面,全球眾多生物制藥公司已經(jīng)開始大力投資AI技術(shù),并取得了一系列的技術(shù)儲(chǔ)備和重要進(jìn)展。

AI在生物制藥領(lǐng)域的應(yīng)用具有巨大的潛力,因此創(chuàng)新藥研發(fā)公司需要投入大量的算力資源來(lái)建立和維護(hù)AI系統(tǒng)。在這一方面,云計(jì)算平臺(tái)和大算力芯片的組合,為生物制藥領(lǐng)域描繪了更加令人振奮的前景,勢(shì)必將大力推動(dòng)該領(lǐng)域的發(fā)展,帶來(lái)更多機(jī)會(huì)和可能。

NVIDIA 為醫(yī)療健康和生命科學(xué)行業(yè)提供 AI 智能計(jì)算平臺(tái)

NVIDIA 英偉達(dá)為包括制藥在內(nèi)的醫(yī)療健康和生命科學(xué)行業(yè)的企業(yè)提供領(lǐng)先的人工智能計(jì)算平臺(tái),為AI制藥領(lǐng)域的蓬勃發(fā)展注入強(qiáng)大推動(dòng)力。 AI算法需要海量、高效的計(jì)算資源快速處理龐大的數(shù)據(jù)集和模型訓(xùn)練。以AlphaFold2蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)模型為例,模型需要使用數(shù)百塊 GPU,花費(fèi)數(shù)周時(shí)間來(lái)完成模型訓(xùn)練。隨著算力的不斷提升,生物制藥公司將利用大量計(jì)算資源,快速準(zhǔn)確地識(shí)別潛在藥物、深入理解和精準(zhǔn)預(yù)測(cè)藥物的作用機(jī)制,專注于新型藥物的研發(fā)。創(chuàng)新藥將會(huì)被更快地推向市場(chǎng),從而實(shí)現(xiàn)行業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。

本次大賽中,NVIDIA 提供了領(lǐng)先的算力支撐,加速了AI模型訓(xùn)練和推理,助力參賽選手AI算法方案的構(gòu)建和部署。

云計(jì)算平臺(tái)加速生命科學(xué)新突破

隨著AlphaFold2等人工智能技術(shù)的發(fā)展,計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)已經(jīng)成為現(xiàn)實(shí),人工智能對(duì)生命科學(xué)和生物制藥領(lǐng)域的突破也正在加速。

阿里云在生物信息和制藥領(lǐng)域提供多種解決方案,包括公有云的基因分析平臺(tái)、第三代測(cè)序組裝解決方案以及提供計(jì)算任務(wù)優(yōu)化和藥物設(shè)計(jì)解決方案,通過(guò)AI計(jì)算推理優(yōu)化,使用多卡并行、混合精度、編譯優(yōu)化等方式提高推理速度。

針對(duì)重要的生物信息行業(yè)化應(yīng)用,阿里云提供應(yīng)用云化、應(yīng)用加速優(yōu)化等方式服務(wù)高校、科研、臨床以及企業(yè)級(jí)客戶,其中包含蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、分子動(dòng)力學(xué)應(yīng)用等多款行業(yè)重要應(yīng)用,并通過(guò)不同的測(cè)試發(fā)現(xiàn)了在應(yīng)用優(yōu)化中的瓶頸,為客戶提供更高效的存儲(chǔ)、計(jì)算資源配置,加速生物信息行業(yè)發(fā)現(xiàn)。

在前期的產(chǎn)學(xué)合作方面,阿里云與浙江大學(xué)等眾多國(guó)內(nèi)外知名高校團(tuán)隊(duì)合作,快速搭建了生物醫(yī)藥領(lǐng)域的云上集群,并通過(guò)深度學(xué)習(xí)計(jì)算框架實(shí)現(xiàn)有價(jià)值的重要科研突破。此外,阿里云還積極參與國(guó)際、國(guó)內(nèi)和行業(yè)性安全合規(guī)標(biāo)準(zhǔn)的建設(shè),并取得了多項(xiàng)專利和三方獨(dú)立機(jī)構(gòu)的認(rèn)證。本次天池大賽亦是一次通過(guò)加強(qiáng)企業(yè)、研究機(jī)構(gòu)和專業(yè)人士之間的合作和交流的有益嘗試,在吸引人才并推廣AI在各個(gè)領(lǐng)域的應(yīng)用,起到了重要作用。

在本屆大賽中,參賽隊(duì)伍展示了令人印象深刻的創(chuàng)新思路和高超技巧,充分證明了人工智能在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的強(qiáng)大潛力。同時(shí),大賽也為行業(yè)內(nèi)的專業(yè)人士提供了一個(gè)展示實(shí)力和交流的平臺(tái)。通過(guò)本屆大賽的舉辦,不僅推廣了AI在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用,還為行業(yè)的高質(zhì)量發(fā)展提供了有力的支持。未來(lái),我們期待更多的AI生物智藥大賽能夠在全球范圍內(nèi)舉辦,在AI藥物研發(fā)領(lǐng)域,凝聚起各方有志克難攻堅(jiān)的力量,為全人類更好的生活和生命質(zhì)量,迎難而上,邁出堅(jiān)定步伐。

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