隨著CentOS停更，用戶無法獲得安全補丁和漏洞修復(fù)，導(dǎo)致系統(tǒng)安全風(fēng)險大幅增加、穩(wěn)定性下降。對于依賴特定軟件環(huán)境的高校及科研機構(gòu)，還可能出現(xiàn)系統(tǒng)與應(yīng)用軟件兼容性問題，影響科研項目進度并增加額外適配成本。
面對這一問題，廈門高校創(chuàng)新實驗室(簡稱實驗室)將OS遷移至龍蜥商業(yè)版服務(wù)器操作系統(tǒng)元腦KOS V5.8，方便用戶使用各類業(yè)務(wù)軟件，促進AI+Science科研創(chuàng)新進程。KOS團隊通過提供定制化鏡像，預(yù)置Lustre、Slurm等科學(xué)計算場景軟件包，快速適配支持120+科學(xué)計算應(yīng)用軟件，同時研制配套集群部署腳本，實現(xiàn)了7天高效遷移300臺節(jié)點。
軟硬件環(huán)境復(fù)雜，操作系統(tǒng)遷移面臨挑戰(zhàn)
作為國內(nèi)領(lǐng)先的能源材料領(lǐng)域“科技加速器”與“產(chǎn)業(yè)發(fā)動機”，實驗室面向先進材料、氫能、半導(dǎo)體、未來顯示技術(shù)等7大領(lǐng)域方向，打造支撐AI for Science科研新范式的智算平臺。硬件方面配置了數(shù)百個異構(gòu)計算節(jié)點，多個胖節(jié)點及管理節(jié)點，為大規(guī)?？茖W(xué)計算、模擬仿真、數(shù)據(jù)處理和分析存儲等需求提供了有力的支撐;軟件方面，為了支撐能源、信息、制造等領(lǐng)域科研項目，智算平臺部署120+款多學(xué)科、跨單位交叉業(yè)務(wù)軟件，并且需要不斷進行軟件升級，以滿足日益增長的計算需求。
此前，中心全套業(yè)務(wù)系統(tǒng)運行在CentOS 7.5之上，隨著CentOS 7停更，導(dǎo)致一些業(yè)務(wù)軟件無法使用，并且系統(tǒng)存在安全隱患，迫切需要對原有操作系統(tǒng)進行遷移。面對如此龐大復(fù)雜的系統(tǒng)環(huán)境，操作系統(tǒng)遷移可謂是一項挑戰(zhàn)。
首先，新系統(tǒng)需要與原有軟硬件環(huán)境兼容適配，確保業(yè)務(wù)系統(tǒng)在遷移后能夠穩(wěn)定運行。在實驗室中存在大量應(yīng)用軟件，如有限元素法軟件abaqus、經(jīng)典分子動力學(xué)模擬軟件Lammps、分子動力學(xué)模擬程序包GROMACS、DFT計算和分子動力學(xué)模擬軟件CP2K等，新操作系統(tǒng)要適配上述業(yè)務(wù)軟件，保障運行可靠性與穩(wěn)定性。
其次，操作系統(tǒng)遷移要盡量減少對現(xiàn)有業(yè)務(wù)影響，這就意味著遷移工作必須迅速高效。實驗室服務(wù)于廈門市及福建省眾多高校、科研機構(gòu)與企業(yè)的重大課題與產(chǎn)學(xué)研合作項目，操作系統(tǒng)切換需要盡可能地平滑穩(wěn)定、用戶無感知，避免影響當(dāng)前集群的對外服務(wù)能力。
最后，為了應(yīng)對高速增長的大規(guī)?？茖W(xué)計算需求，實驗室需要在操作系統(tǒng)切換過程中，對現(xiàn)有IB卡驅(qū)動、Slurm版本及關(guān)鍵部件驅(qū)動進行同步優(yōu)化升級，新操作系統(tǒng)要能夠支持最新驅(qū)動版本。
“三步走”實現(xiàn)7天遷移300節(jié)點，樹立行業(yè)典范
浪潮信息為實驗室量身定制了從CentOS到KOS的遷移方案，摸排用戶環(huán)境的硬件配置、軟件環(huán)境、數(shù)據(jù)規(guī)模等，充分評估遷移可行性并識別風(fēng)險，通過“三步走”穩(wěn)健推進，實現(xiàn)操作系統(tǒng)平滑遷移。
從CentOS到KOS遷移方案
■ 首先，計算節(jié)點與管理節(jié)點兼容性測試。KOS團隊在計算節(jié)點集群中剝離出部分節(jié)點，驗證計算節(jié)點更換KOS后能夠正常訪問、調(diào)用存儲節(jié)點上的業(yè)務(wù)軟件;同時選取與管理節(jié)點配置一致的機器，作為新集群的管理節(jié)點，部署集群管理業(yè)務(wù)、進行兼容性測試。
■ 其次，管理節(jié)點數(shù)據(jù)遷移。KOS團隊利用剝離出來的機器搭建新集群，并將舊集群管理節(jié)點數(shù)據(jù)遷移到新集群中。此時新舊集群并存，舊集群對外提供服務(wù)，新集群進行業(yè)務(wù)測試。
■ 最后，計算節(jié)點分批升級。新集群測試完成后，KOS團隊根據(jù)當(dāng)前用戶任務(wù)情況，分批次添加計算節(jié)點，直到新集群中的計算節(jié)點占到總集群的60%(剩余40%繼續(xù)在舊集群中提供服務(wù))，且用戶作業(yè)不受影響，則啟用新集群對外提供服務(wù)，同時停止舊集群。最后，剩余40%計算節(jié)點加入新集群，完成全部升級。
“三步走”替換示意圖
此次升級，不僅解決了 CentOS 停更所帶來的生態(tài)缺失、業(yè)務(wù)中斷隱患，也為用戶帶來了更佳體驗。
兼容更優(yōu)：KOS高度兼容實驗室異構(gòu)化硬件平臺，以及全部存儲軟件與應(yīng)用軟件，確保了用戶操作習(xí)慣無縫銜接，同時針對計算節(jié)點、管理節(jié)點及業(yè)務(wù)軟件進行全面的版本優(yōu)化升級，為用戶提供更加流暢、高效的科研環(huán)境。目前KOS已與1200款硬件板卡、250款服務(wù)器整機、400款數(shù)據(jù)庫及中間件實現(xiàn)兼容適配。
效率更高：KOS進行了定制化鏡像開發(fā)，將GPU驅(qū)動、IB卡驅(qū)動、Lustre客戶端、Slurm、OpenLDAP等核心軟件升級為最優(yōu)版本并集成到鏡像中，以“開箱即用”的模式完成升級替換。
絲滑無感：遷移過程采取了“小步快跑”策略，通過細致入微的集群業(yè)務(wù)摸排評估，以及小批量節(jié)點遷移、測試、驗證，確保CentOS平滑穩(wěn)定遷移至KOS，全過程風(fēng)險可控，在最短的空窗期內(nèi)完成新舊集群服務(wù)交割，用戶無感知持續(xù)進行科研工作。
實驗室負責(zé)人表示：“在CentOS停止維護的緊迫形勢下，KOS為我們提供了及時且高效的解決方案。KOS的穩(wěn)定、可靠與高度兼容性，讓用戶可以更簡單便利地編譯和安裝大部分最新版本的計算軟件，無需再應(yīng)對各種版本過低導(dǎo)致的兼容問題。對于有興趣追求性能或者探索新特性的用戶，也有諸如XPMEM等新功能可供使用。有了KOS的幫助，讓我們對未來的科研創(chuàng)新充滿信心。”
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