9月28日，在“四川大學125周年校慶活動暨第七屆生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)·智能技術應用峰會”開幕式上，四川大學華西醫(yī)院、華為技術有限公司、賽樂基因科技（北京）有限公司聯(lián)合發(fā)布多組學數(shù)據(jù)加速分析平臺，該平臺基于GPU加速，集數(shù)據(jù)存儲、計算、管理、使用為一體，旨在推動基因測序技術創(chuàng)新，加速醫(yī)療行業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型。
華西醫(yī)院、華為、賽樂基因聯(lián)合發(fā)布“多組學數(shù)據(jù)加速分析平臺”
目前，基于該平臺已經(jīng)取得重大階段性進展：30X人類WGS胚系變異分析時間從24小時縮短至7分鐘，這是全球首次將人類全基因組分析推進至分鐘級時代，在多組學數(shù)據(jù)分析領域具有跨時代的意義。
隨著新一代基因測序技術（Next Generation Sequencing，NGS）和測序儀的發(fā)展，基因測序速度不斷提升，測序成本不斷下降，人類全基因組的測序成本從過去的30億美金已經(jīng)下降到500美金，由此帶來了基因相關科學研究和應用的快速發(fā)展，目前基因測序技術已經(jīng)在生育健康、腫瘤個體化診斷和治療、遺傳病、傳染病檢測、疫苗研發(fā)等領域獲得廣泛的應用，為精準醫(yī)療和個性化醫(yī)療帶來眾多革命性創(chuàng)新。
與基因行業(yè)的快速爆發(fā)相對應，基因測序數(shù)據(jù)則呈現(xiàn)指數(shù)級增長趨勢，未來有可能比肩天文數(shù)據(jù)量。當前每臺最先進的基因測序儀每天產(chǎn)生的測序數(shù)據(jù)已經(jīng)達到6TB，每年產(chǎn)生的數(shù)據(jù)則高達數(shù)十PB，且需要永久保存。為了及時分析這些海量的基因數(shù)據(jù)，測序企業(yè)和科研機構往往需要投入高額資金建設高性能計算集群和數(shù)據(jù)中心。因此，基因數(shù)據(jù)的分析速度與成本日益成為掣肘基因測序行業(yè)發(fā)展的關鍵因素。如何提升基因數(shù)據(jù)的分析效率、降低成本投入成為業(yè)內(nèi)公認必須解決的新課題。
此次三方創(chuàng)新合作，充分發(fā)揮了華西醫(yī)院在多模態(tài)組學數(shù)據(jù)分析和基因應用等領域的領先學術和產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢，華為公司在高性能數(shù)據(jù)存儲和先進基因數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)上的技術積累，以及賽樂基因在GPU加速生物信息數(shù)據(jù)分析領域的行業(yè)經(jīng)驗。面向未來，三方的創(chuàng)新合作有望在基因測序領域，以數(shù)據(jù)為驅(qū)動，以創(chuàng)新為引擎，加速數(shù)據(jù)與存儲技術賦能生物科技產(chǎn)業(yè)，促進甚至引領醫(yī)療行業(yè)的數(shù)字化變革。
華西醫(yī)院數(shù)據(jù)科學家于浩澎博士發(fā)表演講
“多組學大數(shù)據(jù)時代已經(jīng)到來，華西醫(yī)院多組學數(shù)據(jù)加速分析平臺創(chuàng)新性地引入華為OceanStor Pacific面向多樣化算力的融合分析數(shù)據(jù)底座，以及賽樂基因BaseNumber基因數(shù)據(jù)分析GPU加速方案，推動多組學數(shù)據(jù)分析邁入分鐘級時代?！比A西醫(yī)院數(shù)據(jù)科學家于浩澎博士在下午的演講中提到，“此項研究成果的發(fā)布，將加速精準醫(yī)療大數(shù)據(jù)在醫(yī)學上的廣泛應用?！?/p>
華西醫(yī)院作為醫(yī)學科研機構的龍頭，深刻理解醫(yī)療行業(yè)業(yè)務需求，賽樂基因在基因數(shù)據(jù)分析技術領域深耕多年，華為公司則能提供最好的數(shù)據(jù)基礎設施平臺。此次ICT技術與生命科學的融合創(chuàng)新，將加速智慧醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展，為未來的基因科學做出貢獻，促進人類的健康福祉。
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